會計核算電算化是指用計算機代替手工記賬、算賬、報賬這一過程。它是會計電算化最重要的組成部分。 會計核算電算化是會計電算化的*9個層次，主要內容包括：設置會計科目、填制會計憑證、登記會計帳簿、進行成本計算、編制會計報表等。會計核算電算化主要是指這幾個方面運用會計核算軟件，實現會計數據處理電算化
（一）設置會計科目電算化
設置會計科目電算化是通過會計核算軟件的初始化功能實現的。初始化功能是供軟件開始正式投入使用時運用的功能，除了輸入一級會計科目和明細會計科目名稱及編碼外，還要輸入：會計核算所必需的期初數字及有關資料，包括年初數、累計發生額，往來款項、工資、固定資產、存貨、成本費用、營業收入核算必需的期初數字；計算有關指標需要的各種公式；選擇會計核算方法，包括固定資產折舊方法、存貨計價方法、成本核算方法等；定義自動轉帳憑證；輸入操作人員崗位分工情況，包括操作人員姓名、操作權限、操作密碼等。
（二）填制會計憑證電算化
會計憑證包括原始憑證和記帳憑證，對這兩類憑證的處理方法，在各個會計核算軟件中有所不同。記帳憑證是根據審核無誤的原始憑證登記的，有的會計核算軟件是要求財會人員手工填制好記帳憑證，再由操作人員輸入電子計算機；有的會計核算軟件是要求財會人員根據原始憑證，直接在計算機屏幕上填制記帳憑證；有的會計軟件是要求財會人員直接將原始憑證輸入電子計算機，由計算機根據輸入的原始憑證數據自動編制記帳憑證。前兩種方法比較接近，區別只在一個是輸入已經手工寫好的記帳憑證，一個是邊輸入邊做記帳憑證，但都是把所有的記帳憑證輸入電子計算機。而最后一種方法與前兩種有很大的差別，是由計算機來做記帳憑證。
（三）登記會計帳簿電算化
會計電算化后，登記會計帳簿一般分兩個步驟進行，首先是由計算機根據會計憑證自動登記機內帳簿，其次是把機內會計帳簿打印輸出。
（四）成本費用計算電算化
根據帳簿記錄，對經營過程中發生的采購費用、生產費用、銷售費用和管理費用，進行成本費用核算，是會計核算的一項重要任務。在會計軟件中，成本計算是由計算機根據機內上述費用，按照會計制度規定的方法自動進行的。許多通用會計軟件提供了多種成本計算的方法，供用戶選用。
（五）編制會計報表電算化
編制會計報表工作，在通用會計軟件中都是由計算機自動進行的，一般都有一個可由用戶自定義報表的報表生成功能模塊，它可以定義報表的格式和數據來源等內容，這樣無論報表如何變化也都可以適應。
