物流企業主要從事代理服務和運輸、倉儲等業務，因為同時涉及交通運輸業和服務業，且兩種行業的稅率又有所不同，這就為其進行納稅籌劃提供了空間。
案例一：吉祥廠是一家生產水泥的廠家，其產品的市場銷售價格為520元/噸（不含增值稅），如意公司為一家物流公司，由于該公司每年可以為吉祥廠銷售30萬噸產品，所以享受500元/噸的優惠價格?，F在有一家廣廈房產企業需要購買5 000噸吉祥廠的水泥。
稅收籌劃方案：如意物流進行代理銷售業務。廣廈集團按照510元/噸的價格直接到吉祥廠購買，如意物流收取吉祥廠5萬元代理費，則廣廈集團仍然只需支付298.35萬元，而如意物流所得的5萬元可以作為代理收入，只需按照5%繳納營業稅0.25萬元，如意物流的純利潤為5－0.25=4.75（萬元）（忽略城建稅及教育費附加）。
