銀行存款的內部控制制度就是指企、事業單位為維護銀行存款的完整性，確保會計記錄的正確性和可靠性而對銀行存款進行的結算、稽核等自我調節和監督。
內部控制制度應遵循的基本原則。內部控制制度應遵守的基本原則是指企業和設計內部控制制度時所必須遵守的客觀規律和基本法則。
1、互相制約原則。是指在各部門、各崗位之間建立起一種相互驗證或共同驗證的關系，分離經濟業務執行和審查；分離經濟業務記錄和執行；分離財產保管和記錄；分離財產保管和財產核對；分離總賬和明細賬登記，從而達到自動糾錯，防止舞弊現象。
2、管轄范圍原則。是指各部門、各崗位劃分工作范圍，職能范圍，明確其相應的權利和責任，做到有章可循，使各崗位、各部門協調，以達到實現內部控制。
3、成本效益原則。是指實行內部控制制度與實行它而產生的經濟效益，合理確定成本與效益的比例關系，既保證銀行存款的安全完整，同時也達到對其控制管理目的。
