事業(yè)單位應當嚴格區(qū)分財政補助結轉結余和非財政補助結轉結余。財政補助結轉結余不參與事業(yè)單位的結余分配，不轉入事業(yè)基金，單獨設置“財政補助結轉”和“財政補助結余”科目核算。非財政補助結轉結余通過設置“非財政補助結轉”、“事業(yè)結余”、“經(jīng)營結余”、“非財政補助結余分配”等科目核算。
(一)財政補助結轉結余的核算
財政補助結轉資金是指當年支出預算已執(zhí)行但尚未完成或因故未執(zhí)行，下年需按原用途繼續(xù)使用的財政補助資金。財政補助結轉包括基本支出結轉和項目支出結轉。
財政補助結余資金是指支出預算工作目標已完成，或由于受政策變化，計劃調整等因素影響工作終止，當年剩余的財政補助資金。財政補助結余是財政補助項目支出結余資金。
事業(yè)單位應當按照有關部門預算管理的規(guī)定，使用和管理財政補助結轉資金和結余資金。
1.財政補助結轉的核算
事業(yè)單位設置“財政補助結轉”科目，核算滾存的財政補助結轉資金。該科目下設置“基本支出結轉”、“項目支出結轉”兩個明細科目，并在“基本支出結轉”明細科目下按照“人員經(jīng)費”、“日常公用經(jīng)費”進行明細核算，在“項目支出結轉”明細科目下按照具體項目進行明細核算;本科目還應按照《政府收支分類科目》中“支出功能分類科目”的相關科目進行明細核算。
(1)會計期末，事業(yè)單位應當將財政補助收入和對應的財政補助支出結轉入“財政補助結轉”科目。
(2)年末，完成上述財政補助收支結轉后，應當對財政補助各明細項目執(zhí)行情況進行分析，按照有關規(guī)定將符合財政補助結余性質的項目余額轉入財政補助結余，借記或貸記“財政補助結轉--項目支出結轉”科目，貸記或借記“財政補助結余”科目。
(3)按規(guī)定上繳財政補助結轉資金或注銷財政補助結轉額度的，按照實際上繳資金數(shù)額或注銷的資金額度數(shù)額，借記“財政補助結轉”科目，貸記“財政應返還額度”、“零余額賬戶用款額度”、“銀行存款”等科目。取得主管部門歸集調入財政補助結轉資金或額度的，做相反會計分錄。
2.財政補助結余的核算
事業(yè)單位設置“財政補助結余”科目，核算事業(yè)單位滾存的財政補助項目支出結余資金。
(1)年末，對財政補助各明細項目執(zhí)行情況進行分析，按照有關規(guī)定將符合財政補助結余性質的項目余額轉入財政補助結余，借記或貸記“財政補助結轉——項目支出結轉”科目，貸記或借記“財政補助結余”科目。
(2)按規(guī)定上繳財政補助結余資金或注銷財政補助結余額度的，按照實際上繳資金數(shù)額或注銷的資金額度數(shù)額，借記“財政補助結余”科目，貸記“財政應返還額度”、“零余額賬戶用款額度”、“銀行存款”等科目。取得主管部門歸集調入財政補助結轉資金或額度的，做相反會計分錄。
(二)非財政補助結轉的核算
非財政補助結轉資金是指事業(yè)單位除財政補助收支以外的各專項資金收入與其相關支出相抵后剩余滾存的、須按規(guī)定用途使用的結轉資金，通過設置“非財政補助結轉”科目核算，以滿足專項資金專款專用的管理要求。
(1)期末，事業(yè)單位應當將除財政補助收支以外的各專項資金收支結轉入“非財政補助結轉”科目。根據(jù)事業(yè)收入、上級補助收入、附屬單位上繳收入、其他收入本期發(fā)生額中的專項資金收入，借記“事業(yè)收入”、“上級補助收入”、“附屬單位上繳收入”、“其他收入”科目下各專項資金收入明細科目，貸記“非財政補助結轉”科目;根據(jù)事業(yè)支出、其他支出本期發(fā)生額中的非財政專項資金支出，借記“非財政補助結轉”科目，貸記“事業(yè)支出一非財政專項資金支出”或“事業(yè)支出-項自支出(非財政專項資金支出)”、“其他支出”科目下各專項資金支出明細科目。
(2)年末，完成非財政補助專項資金結轉后，應當對非財政補助專項結轉資金各項目情況進行分析，將已完成項目的項目剩余資金區(qū)分以下情況處理：繳回原專項資金撥入單位的，借記“非財政補助結轉”科目，貸記“銀行存款”等科目;留歸本單位使用的，借記“非財政補助結轉”科目，貸記“事業(yè)基金”科目。
(三)非財政補助結余的核算
非財政補助結余包括事業(yè)結余和經(jīng)營結余。事業(yè)結余是事業(yè)單位一定期間除財政補助收支、非財政專項資金收支和經(jīng)營收支以外各項收支相抵后的余額。經(jīng)營結余是事業(yè)單位一定期間各項經(jīng)營收支相抵后余額彌補以前年度經(jīng)營虧損后的余額。
1.事業(yè)結余的核算
事業(yè)單位設置“事業(yè)結余”科目。期末，事業(yè)單位應當結轉本期事業(yè)收支。
年末，將“事業(yè)結余”科目余額結轉入“非財政補助結余分配”科目，借記或貸記“事業(yè)結余”科目，貸記或借記“非財政補助結余分配”科目。
2.經(jīng)營結余的核算
事業(yè)單位設置“經(jīng)營結余”科目。期末，事業(yè)單位應當結轉本期經(jīng)營收支。
年末，如“經(jīng)營結余”科目為貸方余額，將余額結轉入“非財政補助結余分配”科目，借記“經(jīng)營結余”科目，貸記“非財政補助結余分配”科目;注意：如為借方余額，為經(jīng)營虧損，不予結轉。
3.非財政補助結余分配的核算
事業(yè)單位設置“非財政補助結余分配”科目，核算事業(yè)單位本年度非財政補助結余分配的情況和結果。年末，將“事業(yè)結余”科目余額與“經(jīng)營結余”科目貸方余額轉入“非財政補助結余分配”科目后，要按照規(guī)定進行結余分配。有企業(yè)所得稅繳納義務的事業(yè)單位計算出應繳納的企業(yè)所得稅，借記“非財政補助結余分配”科目，貸記“應繳稅費——應繳企業(yè)所得稅”科目。按照有關規(guī)定提取職工福利基金的，按提取的金額，借記“非財政補助結余分配”科目，貸記“專用基金--職工福利基金”科目。然后，將“非財政補助結余分配”科目余額結轉入事業(yè)基金，借記或貸記“非財政補助結余分配”科目，貸記或借記“事業(yè)基金”科目。
